Semula Pondok Pesantren Al Falah hanya sebuah ruangan dibelakang pengasuh yang digunakan untuk pengajian masyarakat. Pada perkembangan selanjutnya, masyarakat memberi kepercayaan kepada pengasuh untuk menitipkan ana-anaknya untuk dididik sebagai santri dan mondok disana. sehingga pada tahun 1976 dibangunlah sebuah ruangan untuk mengaji dan mondok para santri, khususnya santri putra. Namun seiring perkembangan zaman, pada tahun 1992 pondok pesantren Al Falah baru menerima santri putri.
Pada tahun 1997 diadakan penataan dan perubahan sistem pendidikan pesantren guna meningkatkan kualitas pendidikan, disamping kegiatan belajar mengajar pendidikan agama islam, juga ada kegiatan siraman rohani serta tempaan mental spiritual sebagai upaya pendekatan diri kepada Allah SWT. Diantaranya adalah Thoriqoh Qodiriyah Wan Naqsabandiyyah. Dengan tawajjuhan rutin setiap hari ahad pagi. Guna mendampingi pengetahuan agama islam, para santri mulai tahun 2003 diberi tambahan program setara SMP dan program setara SMA pada tahun 2007.
Guna tercapainya derajat kesehatan para santri dan murid madrasah yang optimal, dibawah bimbingan Bpk. Dr.H. Soetomo PS, sejak tahun 2007 telah diadakan kegiatan UKS sekaligus telah dibuka Balai Pengobatan Al Falah
Disinilah letak keunikan dan kekhasan dari Pesantren Al Falah yang setiap hari pengasuh, pendidik, serta para santri berada dalam satu atap dan selalu bertemu menjadi satu, guna peresapan ilmu, pengawasan dan evaluasi menuju keberhasilan